У товарища родной аккумулятор на экспе практически помер, и было решено переделать его в холдер для обычных пальчиковых аккумов. Надо что-то делать с платкой стоящей там, или оставить? Просто одних и тех же аккумуляторов, вставленных в новоиспеченный холдер, хватает на значительно меньшее время, чем если они вставлены в обычный родной холдер.

Плата в родном аккумуляторе это ограничитель тока для заряда. На работу аккумуляторов влиять не должна. Можете оставить, можете выкинуть.